Теоретический семинар ОПР

24/10/2016

3 ноября 2016 года, четверг, в 11:00
Место: малый конференц. зал, 7 корп.
Докладчик: Дмитрий Георгиевич Федоров (National Institute of Advanced
Тема: "Применение метода квантово-химических фрагментов для расчета больших систем"

Аннотация:

В методе квантово-химических фрагментов (МКФ) молекулярная система делится на фрагменты, которые считаются обычными методами квантовой химии. При этом фрагменты считаются в электростатическом потенциале всей системы, а неэлектростатические взаимодействия, а также поправки на описание границ между фрагментами, учитываются за счет проведения расчета пар фрагментов. Этим достигаются две цели - время расчета сильно уменьшается (приблизитлеьно достигается линейная зависимость времени от размера), а также естественным образом из расчета получаются свойства отдельных фрагментов, а также взаимодействий между ними. Для метода МКФ (FMO) разработаны градиенты и Гессианы, позволяющие оптимизировать геометрию, проводить расчеты МД и спектров (ИК и Раман). Метод можно использовать с большинством квантово-химических подходов, в том числе для радикалов, а также с относительно новым и персперктивным методом DFTB, которым реально проводить оптимизации геометрии целых белков, а также 100 пс МД систем с несколькими тысячами атомов. Программа для расчета бесплатно распространяется в составе пакета GAMESS, а графические оболочки доступны отдельно также бесплатно (Facio).

Адрес: Россия, 188300, Ленинградская обл., г.Гатчина, мкр. Орлова роща, д. 1,
ФГБУ «ПИЯФ»

Тел.: +7(813-71) 46025, +7(813-71) 46047,
Факс: +7(813-71) 46047, +7(813-71) 36025

E-mail: dir@pnpi.nrcki.ru

Последнее обновление: 28.10.2016 - Пт  19:45
вебмастер: webadm@pnpi.nw.ru